Можно ли как-то посмотреть, за что долг висит в налоговой Грузии?

Да.

@Аноним: При таком варианте налоговая не видит ваши платежи заполните заявку на зачет налога и в будущем платите или с бизнес-счета, или на сайте налоговой, или через банкинг как и раньше, но ставьте галочку - за третье лицо и там указывайте свои данные ИП (ИНН обязательно)

@Anastasiya: Подозревал именно этот вариант (хотя каждый раз проверял на сайте и деньги зачитались), напишу заявление и впредь буду платить с бизнес-счета, спасибо.