Подскажите, если я подаю на турвизу Японии и планирую встретиться с другом-иностранцем, который находится в стране по рабочей визе, нужно ли его указывать как guarantor/reference или inviter? Или это не нужно/не сыграет особой роли?

Не нужно. И при подаче документов не нужно говорить, что хотите встретиться с другом. Иначе у консула возникнут вопросы и Вас могут на собеседование отправить. + от гарантов нужны отдельные документы консулу со своими заморочками.

Лучше им меньше про вас знать, турист и турист, знакомых нет. Так будет лучше для вас. А приедете- встречайтесь с кем хотите. Если едите как турист - пишите цель туристическая поездка и больше ничего.