Подскажите, пожалуйста, пошлины за визы канадская сторона сама списывает с карты? Все верно? Т. е. не счёт выставляют, а списывают деньги по полным предоставленным данным карты?

Все пошлины вы оплачиваете самостоятельно через сайт canada. ca. Если у вас кто-то просит прислать полные данные карты, включая цифры на обратной стороне, то это мошенники.

Да, как покупку в онлайн-магазине оплачиваете, так и пошлину на сайте IRCC.