Подскажите, пожалуйста, у кого был опыт, если лететь с неоткрытой визой Франции в Женеву и выходить через сторону Франции, ставят там печать прибытия Франции?

Если вы въезжаете в Шенген в Женеве, то вам поставят штамп Женевы. Будут ли что-то расспрашивать пограничники в Женеве - могут спросить, могут не спросить. Но на случай расспросов нужно иметь убедительную легенду, что вы едете во Францию в итоге.

Если вы выходите на французскую сторону, то там пограничный контроль французский и штамп вам ставят они французский. А там уж как-то добираетесь в Швейцарию дальше. Вопросов в Женеве вообще ни разу не было.