Сейчас работаю на компанию в РФ. Через пару месяцев у меня истекает налоговое резидентство в РФ и я становлюсь резидентом Армении.

Если Получение дохода в России, выгоднее это сделать в России, иначе ваш работодатель в рф будет платить намного больше ндфл. Если не ошибаюсь с Арменией у РФ есть договор о двойном налогообложении.

Если Вы откроете ИП в Армении, то при оплате на р. счет такого ИП Ваш заказчик дополнительно будет уплачивать в бюджет РФ 20% агентского НДС. Лучше уточнить у заказчика, готов ли он на это.