Как гражданин и валютный резидент РФ, проживающий в РА, могу переводить рубли со своего рублевого счета в армянском банке на свой рублевый счет в российском банке?

Пока армянский банк будет позволять это делать - можете. сейчас и на зарубежные счета разрешили зачислять иностранную валюту, а на российские запрета и не было.

Со стороны валютного законодательства РФ на рубли никогда не было никаких ограничений.