Скажите, пожалуйста, айтишнику при договоре работы через ИП говорится, что 1-3% платишь, а со стороны, которая производит выплату налогообложение идет как? От государства зависит? Или им не надо?

Они с Вами заключают договор, как с ИП, по правилам отношений, как с юрлицом, Заказчик-Исполнитель. Обычно с их стороны налогов нету, они ложатся на Вас, но бывают исключения в некоторых странах, если Вы являетесь их резидентом, например. Это уже у Вас запросит сам Заказчик при необходимости, сам. И почему 1-3%, Вы уже заранее планируете превысить порог Малого бизнеса в 500 к лари/год?)