Подскажите, пожалуйста, есть где-то инструкция, как выставлять инвойс? Чтобы на заключать договор.

Инвойс и заключение договора - это разные этапы Вашей деятельность. Инвойс как раз, если выставляется, то на основании договора все же. Здесь не регламентированы ни договора, ни инвойсы, составляете либо по законодательству страны заказчика, либо, как договоритесь. Можно воспользоваться различными сервисами либо просто в ексель.