Можно ли посетить Сингапур потом сгонять в Малайзию и вернуться обратно на Бали по транзитной визе?

Можно, если из Сингапура билет в Малайзию будет.

Можно получить транзитную визу на 96 часов в Сингапуре при наличии билета в третью страну.

Если на руках будут все билеты и они будут реальны, максимальный срок пребывания в сингапуре не нарушен, и остальными доками все ок, то вопросов конечно позадают но пустят везде.