Кто живет в Португалии, подскажите: мне предложили сделать контракт на аренду Contrato de comodato , но я не совсем понимаю что это за контракт

Зарегистрировать его в налоговой хозяин не сможет - он безвозмездный. Всё остальное работает как при обычном контракте аренды.

Тут надо смотреть в контексте ваших обстоятельств, как вы собираетесь получать ВНЖ. Потому что главный вопрос - примет ли такой контракт консульство/SEF.