Подала нологовую декларацию по ип в Грузии за декабрь 31 декабря, а она зачлась как за ноябрь.

Вы не могли 31го за декабрь подать, только за ноябрь.

Перепроверьте, какие декларации и за какие периоды у Вас поданы, в реестре деклараций. Всегда засчитывается только последняя поданная за период декларация и налог, соответственно, пересчитывается, исходя из внесенных изменений. Если что-то непонятно, можете задать вопрос в онлайн-чате в личном кабинете налоговой, в рабочее время, на гнрузинском в грузинской версии, либо на английском - в английской версии кабинета. Либо надо досконально смотреть