Подскажите, пожалуйста, какой примерно срок обычно нужен, чтобы заявка на продление no lucrativa, поданная через mercurio, начала отслеживаться по номеру expediente?

От региона зависит, в норме от пары дней до 1,5-2 недель. В мск консульстве так же обычно до ~2 недель. Особо наглые эстранхерии типа Валенсии не вносят в систему данные месяцами.