Подскажите, как лучше поступить с валютой при поездке в Японию: купить доллары и обменять в Японии, или взять йены в России?

Если найдёте йены по хорошему курсу - берите, если нет - тогда доллары. Можно частями, чтобы не искать, где излишки йен обменять на доллары. Считали несколько раз: примерно одинаково по деньгам. Тут только Ваши возможности и время на походы в банки.