Подскажите пожалуйста, если поставили печать в паспорте в аэропорту Эрджана, можно летать через Ларнаку или будут проблемы? У нас немецкий и израильский паспорт.

С такими козырями откуда могут быть проблемы)) Но обычно все придерживаются тактики откуда влетел, оттуда вылетел. Из вашего вопроса непонятно, хотите ли вы влететь на север и вылететь с юга.