Собираюсь приехать в Казахстан на поезде и пересечь границу по загранпаспорту, чтобы потом не было проблем с оформлением РВП и т. п.

Лучше брать билеты на загран и пересекать по загранпаспорту!!! Во избежание проблем. Если пересечете по внутреннему, не будет штампа в паспорте о пересечении (это нужно в банк для получения карты и бог знает для чего ещё!)

На всякий случай повторюсь. Можно взять билеты на внутренний паспорт, а на пограничном контроле дать загран, чтоб штамп поставили.

Летел самолётом. Билеты покупал на внутренний, пересекал границу по внутреннему, а в КЗ по заграну. Штампа, естественно, со стороны РФ не было. Спокойно пропустили.