С испанской визой купила билет в Барселону с транзитом в Риге, меня здесь остановили и поставили штамп «отказ во въезде»,(

Такие ситуации были по земле, людей не пускали в Эстонию, хотя у них было право въехать в Латвию. С такой печатью они потом въезжали в Латвию через прямую границу.... Предполагаю, что вы сможете влететь в Испанию через любой шенген, кроме стран Балтии, Польши, Чехии и Финляндии, но лучше уточнить в консульстве Испании.