Подскажите, пожалуйста, в пункте full name in native alphabet нужно ли указывать отчество? И так ли критично, если я его не указала?

Анкета универсальна для всех стран, отчество существует лишь в 5-6 странах. В международной практике full name - это фамилия и имя, именно поэтому в загранпаспорте при транслитерации оно не указывается. Поэтому пишете, скажем, Иванова Мария.

Вам надо написать на русском свои имя и фамилию.