Подскажите пожалуйста: летим в Чунцин с пересадкой в Шанхае, где понадобится код здоровья? Или его лучше вообще до вылета из России заполнить.

Понадобиться при прохождении таможни в Китае, у вас это видимо Шанхай.

Лучше до вылета из России. Но он действует только 24 часа.

В Шанхае надо будет пред’являть кол для выхода из международного терминала. Можете заполнить в мск перед вылетом, можете по прилету в Шанхай, там погранцы помогут, но если ожидание между рейсами небольшое - лучше сделать в мск и не тратить время там.