Лечу в Таиланд через Шеньчжэнь, транзит 22 часа, одна и та же авиакомпания, НО мне не выдали второй посадочный, и придется забирать багаж и заново проходить регистрацию. Пустят ли меня? Могут ли возникнуть проблемы?

Пустят.

Вряд ли возникнут проблемы. Они же понимают, что ваш багаж прилетел.. Куда они его денут? Только если сами найдут и снова оформят Но странно, что вам не до конечного пункта сделали. Плюс у вас на руках билет из страны, тогда дают визу. Могут кривляться и злобно фыркать, но надо ждать и настаивать. А может молча дадут и пожелают удачи.