Лечу во Францию по шенгену ( французскому, там его и открою). В дальнейшем хочу полететь в Германию на самолете.

По идее внутри границ нет. Погранцов не встретите. Регистрируйтесь онлайн, по штрихкоду проходите и на посадке просто смотрят совпадение ФИО с посадочным талоном. Исключения конечно возможны.

Вы откуда в Германию полетите? Если из Франции, то паспортного контроля нет, только ID контроль авиакомпанией, посмотрят паспорт, визу даже могут не проверять. А если вы хотите лететь из России в Германию с французской визой, то это плохая идея. Сейчас лучше избегать любых въездов в/из/через Германию.

Если больше дней в этой поездке будет во Франции, - то проблем не будет. Если прилетите во Францию и на след день в Германию и оттуда же обратный билет, - проблемы могут быть. Паспортного контроля нет, но выборочную проверку никто не отменял.

Езжайте на поезде и все .

Да нет никаких проблем, это древний миф, еще с незапамятных времен, о том что пересекать и въезжать надо исключительно через страну, выдавшую визу. Просто у вас на руках должна быть распечатан ваш маршрут, быть брони отелей и так далее. Ни один погранец вам не откажет, если вы четко отвечаете на все вопросы.