Из Турции можно подаваться в на визу Германии с непродленным ВНЖ (то есть он был, но не продлили)?

Да, можно. Но нужно звонить в iData и через них все делать. Если вы один, то скорее всего подача будет через их офис. Если семья, то они запишут в очередь в консульство.