У супруги заканчивается загранпаспорт российский менее чем через месяц. В нем ВНЖ Германии до окончания действия паспорта.

Предположу, что Вам с таким вопросом лучше обратиться в Ауслендрамт или написать письмо в Бундесполицай, подробно описав ситуацию, чтобы на границе у Вас был ответ с подтверждением.

Могут быть большие проблемы. Можно уточнить в погран службе/бундесполицай Германии. Почему бы не сделать паспорт через посольство в Германии?