Жена - третье поколение евреев, начинаем оформлять документы по её деду-еврею ( то есть мужской линии, мать - русская)

Раз жена рождена в браке, то скорей всего у консула вопросов не возникнет. Но обратите внимание вот на что - если евреем был дед по отцу, то и отец жены должен быть рожден в браке, это важно.

Не надо делать днк-тест самим, только зря деньги потратите. Если даже консул решит, что в вашем случае необходимо провести днк-подтверждение, то тест должна будет проводить израильская аккредитованная лаборатория в рамках судебного решения на основании решении консула, вы в Москве (или где вы проходите кп) сдадите образцы, их отправят в Израиль. В общем, не бегите впереди паровоза, просто будьте морально готовы. Хотя вроде бы днк-тесты касаются совершенно другой процедуры (когда гражданин Израиля подтверждает своего ребёнка, рожденного вне брака), а репатриантов не касается. Но если вдруг консулу что-то не понравится, может затребовать. Поэтому лучше соберите максимально все документы, чтобы у консула не было повода придираться)

Мне кажется, в вашем случае не будет проблем. Обычно даже свидетельства об установлении отцовства хватает, если оно оформлено сразу после рождения, а не через годы. И про ДНК вам уже написали. Только по решению израильского суда и очень дорого, про запас не сделаете.

В вашем случае проблемы быть не должно: есть позиция МВД, которая выглядит так: если отец до истечения двух лет с момента рождения появился (именно вписан в свидетельство) это норм, если после- то ненорм. Намекают (предлагают) ДНК (так-то консул не имеет права официально направлять). Когда ребенок родился в браке раньше, чем через 9 месяцев, просто смотрят более внимательно. У вас такого, насколько я понимаю, нет, отец вписан с самого начала, просто обязательно нужно взять справку о рождении со всеми сведения, включая информацию о том, менялась ли актовая запись. Ну и, если возможно, хорошо было бы, если бы были какие-то свидетельства совместной жизни или отношений родителей до рождения ребенка. Практика по ДНК такая- это очень строго (процедура, расписанная до мелочей), долго и дорого, если делать с адвокатами (а без них будет еще дольше). Мне кажется, параллельно запускать процесс ДНК не стоит.