У меня паспорт РФ, ВНЖ в Литве. Приехала из Вильнюса в Минск на автобусе, довольно быстро прошли границы.

Покупайте билет, Литва пропустит.

По большому счету, их не должно волновать, какое у вас основание для транзита. этоЭответственность пассажира. можете говорить что-то вроде "у меня другой документ", если по какой-то причине не хотите озвучивать, что есть ВНЖ. А еще можно покупать на сайте ржд и не париться. Литва с внж пропускает. РБ от вас вообще ничего не надо для транзита. У вас подходящие документы.