Если по репатриации уехать в Израиль и через пару месяцев уехать на пару недели в Россию. Можно ли так делать и какие последствия будут?

Можно, вас никто не держит. Если вы уезжаете ненадолго, можно никого не уведомлять. Если более, чем на полгода, нужно сообщать в Битуах леуми, чтобы вам не начали начислять взносы за медицину. Ну, и если отсутствовать будете больше года с момента репатриации, корзину тоже не получите оставшуюся.