С мужем планируем поездку в Японию, думаем, как лучше поступить, взять пакет или попробовать всё организовать самостоятельно, самим искать гидов и самим планировать своё путешествие. Буду благодарна за советы.

Я сам самостоятельный турист, в жизни никогда не брал туры и пакеты, поэтому по этой части не сориентирую, но. Если вы планируете самоходом, то крайне рекомендую составить детальный план поездки (что, куда, когда) с вариантами. Потому что все планы имеют свойство смываться в унитаз первым же ливнем (горький опыт). Учитывая, что посольство на подачу визы требует план поездки как выложили выше, то вам даже и придётся его делать, просто в двух версиях - кратко для визы и расширенно для себя. Можете обзвонить свои турагентства, сравнить их цены и прикинуть, во сколько вам обойдётся самоходом в Японию (обычно дешевле, но иногда...) С турами удобнее, но вы лишаетесь самостоятельности, куда все, туда и вы; и если вы хотите, скажем, сгонять в Киото, когда у всей группы шопинг, то гиды могут и не дать.

Здесь вопрос вашего внутреннего самоощущения и денег) Скажу так - хороший гид это всегда круто (и обычно дорого), тур - зависит от организаторов. Тут было как-то сообщение, что типа срочно нужен гид, мы тут поездку организовали))) Можно нарваться на "авторский тур", который проведут полные непрофессионалы. В то же время, многие не хотят тратить время и нервы на самостоятельный поиск - так пошёл, деньги заплатил и гадать 4 или 5 дней в Токио не нужно, усё по расписанию, правда и свободы не особо. Поэтому тут давать однозначные советы трудно.