Подскажите, пожалуйста, я правильно понимаю, что на момент подачи документов в Консульство на визу Д no lucrativa, в РФ нельзя работать по трудовому договору?

Законодательного запрета работать в РФ нет, но если Вы работаете в РФ, то консульство может усомнится в Ваших намерениях жить в Испании. Работать на территории Испании, имея no lucrativa Вы не имеете права.