Подскажите, пожалуйста, чтобы успеть до 1 июля податься на репатриацию в Латвию, лучше в консульство записаться или в визовый центр?

Визовые центры не принимают ничего по репатриации, они занимаются только и исключительно визами. Визы и вопросы гражданства-иммиграции итп это даже разные Министерства, МИД и МВД. Но при этом консульство, как орган МИД, всё же берёт на себя роль посредника-передатчика документов в МВД но второгл посредника в это дело не вмешивает.

В Москве пока визовый центр на Латвию ничего не принимает, только посольство, по старому адресу на Чаплыгина , куда надо ловить слоты.

Только в консульство, ловить слот.. Они отвечают по утрам на вопросы по телефону, говорят, я сама не звонила.