У меня по программе бакалавриата было два диплома, один американский, другой российский.

За два бакалаврских образования вы получите больше, чем за одно, плюс сможете максимизировать баллы в секции transferability при соблюдении остальных условий, поэтому имеет смысл эвалюировать оба образования.