С Гонконга хочу полететь в Токио. Требуется ли виза? И есть пути ( через паром например ) чтоб пробраться с Японии в Россию ?

Условия въезда зависят не от страны откуда вы летите, а гражданин какой вы страны.

необходимость визы зависит от того, гражданином какой страны вы являетесь, а не от места вылета. Паромы из Японии в РФ не ходят, как и наоборот. Прямого авиасообщения тоже нет.