Лечу в Малайзию через Таиланд. Пожалуйста подскажите чтобы получить визу в Таиланде, можно ли платить там сбор картой или строго нужен нал?

Можно.

Вы хотите в Тайланде получить визу в Малайзию? Или в Малайзии получить тайскую? Если в Малайзии тайскую, то только наличные MYR без сдачи, да и в принципе практически всегда при получении визы только наличные.