Подскажите, будут ли проблемы с визараном, если срок годности загран паспорта меньше 3-х месяцев, подали документы на новый загран, но когда он будет готов еще непонятно.

По закону - проблемы быть могут.

Идти к инспектору по странцам и рассказывать, что ждёте паспорт.. Ну или ехать на короткий визаран с кем-то, кто знаком с пограничниками и договорится (не въезжая в Боснию)