Для открытия эцп на портале нужен "пароль на хранилище ключей"-все обладатели эцп его знают? Что делать, если владелец не знает пароля?

Это пароль, который задает сам пользователь при создании ЭЦП. Если в ЦОНе подпись делали, ему сказать должны были или попробуйте простой подобрать, типа 111. Если не вспомнит пароль - ЭЦП заново перевыпускать надо с походом в ЦОН.

Если ЭЦП РФ, то вам нужны коды по умолчанию от вашего токена (гуглите по бренду). Если РК, то пароль ищите в названии папки с ключом. Сама охренела, когда сработало.