Может кто-то помочь разобраться? Я уже больше 180 дней нахожусь в Ереване, у меня тут открыто ИП.

Да вроде бы как раз на границе вы его и оплатите. единственный нюанс будет при пересечении границы на поезде - там вы можете не успеть сесть в него обратно. ещё можно сделать регистрацию по адресу проживания и сразу оплатить штраф, если попросят ещё раньше можно было оформить бесплатную карту РВП через workpermit, которая подтверждает легальность проживания, но потом их перестали выдавать для ИП, хотя кто-то писал что у него таки получалось оформить. а если её оформят, то значит и за оверстей платить штраф не нужно.

Если у Вас ИП, то скорее всего есть и регистрация (прописка временная) - следовательно штраф не грозит.