Подскажите пожалуйста, если Швейцария не входит в ЕС, ввоз из неё продуктов молочного и мясного происхождения в страны ЕС запрещён или она попадает под какие-то исключения, в отличие от других «третьих» стран ?

Там есть лимиты сколько можно. В обратную сторону, например знаю что можно только 1кг мясо. Из Швейцарии в ЕС не знаю лимиты, но скорее всего вас и не проверят(если на машине), так как цены в Швейцарии намного дороже и обычно люди в Швейцарию ввозят, а не наоборот.