Скажите, граждане РФ могут оформлять загранник в Кыргызстане, не имея на руках еще действующий/истекший загранник? Смогу ли я оформить загран с нуля?

Да, можно оформить без заграничного паспорта в посольстве, достаточно будет внутреннего паспорта РФ. Я сдавал фотки, внутренний паспорт, заявление и чек об уплате сбора.