Если поступаешь с паспортом ЕС, то через 3 года его можно на австрийский поменять или учеба не считается за проживание в стране?

Чтобы паспорт поменять это надо гражданство менять очевидно, по законам Австрии нужно прожить 6 лет, при этом минимум 3 из них работать, поэтому вряд ли.