Подскажите пожалуйста, сделал визу в Японию, действует до 25 апреля, срок действия 14 дней. Я могу полететь 24 апреля и пробыть в стране 14 дней? Или надо раньше лететь?

Да, можно, срок истечения визы (date expired) означает до какого момента в страну можно прилететь, далее вам можно находится на срок, который вам одобрило посольство.

Главное, правильно время в пути рассчитать. И про разницу во времени не забудьте.