Подскажите пожалуйста, если подаваться на визу Португалии по 89.2 (по ИП, находясь уже в стране) - всегда ли это долго (годы) или бывают исключения? Можно ли легально выезжать из страны без потери статуса рассмотрения пока ждёшь?

Бывают исключения - некоторые и по пять лет ждут, вместо обычных двух. После того, как ваш тур. шенген закончился, выехать из Португалии вы можете только в один конец - за новой въездной визой. Если сможете вернуться к собеседованию, то заявка не пропадёт.