подскажите пожалуйста, кто получал гражданство Эстонии по репатриации и соответственно не отказывался от российского гражданства?

Российским - рос. загран. Эстонским - эстонский паспорт. Можно через ворота. Россия иногда спрашивают документ Эстонии.

Для России вы являетесь только гражданкой России и по закону о порядке въезда/выезда вы обязаны выезжать по загранпаспорту РФ, только его и подаёте. При этом вы должны уведомить РФ о втором полученном гражданстве (ссылки о том, как это сделать, в чате были). При этом пограничники РФ имеют право выяснить, как вы собираетесь въезжать в другую страну, то есть потребовать от вас ваш другой документ (паспорт Эстонии). В Эстонию вы въезжаете по эстонскому паспорту. Они могут увидеть, что у вас нет российской визы и спросить у вас ваш другой документ (то есть, российский паспорт). Самостоятельно проявлять иннициативу не надо: то есть всегда подаёте "правильный" паспорт сначала.

Если получили гражданство по предкам можно не отказываться от российского.

На российской границе российский загранпаспорт, на эстонской оба.

Я показываю всегда два паспорта, так как первые несколько раз при пересечении границы каждый раз все равно их просили. Уже несколько лет сразу даю оба паспорта на обеих сторонах, мне не сложно. Но многие показывают на Рф-границе российский паспорт, а на ЭР-границе - эстонский. При необходимости - предъявляют второй.