Летим 16 декабря Милан-Таллин, втроём, потом автобус до Санкт Петербурга, у меня и у дочери ВНЖ Италии и гражданство РФ, муж итальянец, могут ли отказать в посадке на самолёт до Таллина?

Не переживайте, у вас внж Италии на вас не распространяются введенные ограничения. У меня такая же ситуация- внж Италии+ гражданство РФ, ездила недавно в Россию и обратно через Таллин компанией Ryanair проблем не было.