если я выселюсь с квартиры и пару недель поживу у друга (пока ищу другое жилье), может ли предыдущий хозяин аннулировать регистрацию сразу после того как я выселюсь из его квартиры?

Канешно может.

Здравствуйте! Он имеет право это сделать. Необходимо с ним обсудить этот момент, чтобы не анулировал. Снимете жилье автоматически при подаче документов с новым арендодателем регистрация будет на новом месте.