Можно ли на диплом о высшем Апостиль поставить в Консульстве РФ в Португалии?

Нет, апостиль можно поставить только в той стране, где выдали документ. Апостиль на дипломы ставит любой региональный комитет/департамент по образованию в РФ, если диплом российский. Если Вы уже уехали, в консульстве можно получить консульскую легализацию. Сроки и порядок можно попробовать узнать в консульстве (консульском отделе посольства), но обычно это дольше и сложнее чем апостилировать документы в РФ.