Что будет, если по прилету в казахстан не уведомил миграционку, а потом на 31-й день пришел туда делать это уведомление?

Скорее всего ничего.

Вам - ничего не будет. Хозяину - штраф Вам (если из РФ) никакая регистрация не нужна в принципе, находится можно до 90 дней. Хозяин должен уведомление делать в течение 3х дней после заезда на квартиру. В том числе после возвращения из визарана.