Можно ли въехать в Армению по внутреннему паспорту РФ не из РФ?

Лично не проверял, но какая разница откуда? человек на паспортном контроле понятия не имеет с какого вы рейса. Если только вопрос про сухопутную границу... но даже в этом случае, мне кажется, это не должно играть никакой роли.

Смотря из какой страны, из Казахстана точно нельзя.

Смотря откуда. Из Казахстана пишут, что влетают. Из РБ не пускают. Из других стран - смотреть нужно.