может кто-то знает, есть ли аналог ип в чили? или может тут есть айтишники, каким образом можно работать с иностранный компанией в чили?

Ближайший аналог ИП это EIRL, ещё можно работать как независимый профессионал, что-то вроде самозанятого работника в России. Они могут выписывать счета за свои услуги в налоговой онлайн.

Есть. зарегистрироваться в sii занимает минут 5, и потом просто болеты онорарио раз в месяц выписываешь, или на настоящие данные, или на любые левые.