Если я задержусь в Казахстане дольше чем на 90 дней какие штрафы мне грозят? Если я допустим 93 дня пробуду, вместо 90, что будет?

На усмотрение спецслужб. Могут ограничиться предупреждением, опять же, на кого нарветесь, но регламентировано наказание за превышение: например, если не более трех дней — предупреждение и т. п.