Если я въезжаю в Эстонию через Норвегию ( Осло-Рига-Таллинн), это шенген, но не ЕС, хочу с собой взять фотоаппарат и ноутбук, могут ли возникнуть проблемы с техникой при возвращении в Россию из Эстонии?

Не должно быть никаких проблем это личные вещи б/у.

Проблемы с дорогостоящей фототехникой иногда возникают при вьезде в Россию на таможне РФ.

При возвращении таможенные правила не зависят от вашего маршрута. Если какая то дорогая проф. фототехника можнодля спокойствия задекларировать на выезде из рф, тогда у нашей таможни не будет придирок.