После оформления ВНЖ Черногории, можно будет выезжать из страны?

Можно, конечно. Единственный момент нельзя нарушать правила отсутствия 30 дней и 90 с уведомлением полиции в год.

30 дней и 90 с уведомлением полиции для всех закон един. Но по факту, директору фирмы или владельцу недвижимости можно больше отсутствовать, все равно продляют, как правило, на сл год. Если на статус ПМЖ рассчитываете, то нужно соблюдать закон в любом случае, при нарушении 30/90 получить статус ПМЖ не получится.