приехал и заселился в хостел. Там меня зарегистрировали ( как я думал на 90 дней) оказалось что на 1 день, т. е. до 7 дек.

Срок в Уведомлении ни на что не влияет. Его вообще хозяин пишет, а не вы. У вас - 90 дней с даты пересечения границы. Но лучше, конечно, напомнить новому хозяину про Уведомление, чтобы его не оштрафовали.